Apikotomija ili resekcija korijena predstavlja operativni zahvat kod kojeg se odstranjuje vrh korijena i prisutni patološki proces, granulom ili cista. Indikacija za ovaj operativni zahvat su slučajevi kada endodontskim liječenjem nije moguće sanirati patološki proces zbog postojanja nadogradnji, puknutih instrumenata, kalcifikacija ili anatomskih nepravilnosti u kanalu.